影之刃3的副本玩法构建在一个高度自由与随机生成的地图探索框架之上。游戏的主线推进并非线性固定，玩家可以在大地图上自由选择关卡顺序进行探索，这种设计增强了冒险的未知感与重复游玩的价值。副本内的地图布局、敌人配置以及掉落物品均采用随机生成机制，这意味着每一次进入都可能面对不同的房间连接、精英怪位置以及隐藏的商人或盗贼事件。副本中通常设有不同颜色的特殊房间，例如紫色房间可能隐藏着支线任务或强大的精英敌人，而红色区域则往往是关底首领的所在地，这种设计鼓励玩家进行全图探索以触发隐藏内容并获取额外奖励，从而在刷图过程中保持新鲜感。
游戏战斗系统的核心在于独特的技能链设计与深度绑定的心法体系，这直接决定了副本挑战的效率与风格。玩家需要为角色精心搭配两条技能链，每条链上可放置多个技能，实战中只需按顺序触发链首的两个技能，角色便会自动执行一连串华丽的连招。心法则作为可装备在技能上的特殊卡牌，能够为关联技能提供冷却缩减、伤害加成、破甲效果或特殊属性等巨大增益。高品质心法可以通过吞噬其他心法来突破升级，解锁更强大的能力，因此如何根据副本敌人特性和自身流派，将合适的心法与技能链精准搭配，是提升战力、攻克高难副本的关键策略所在。
装备与刻印系统为角色构建提供了丰富的个性化空间，是应对各类副本挑战的战术基础。游戏内装备种类繁多，且存在大量拥有套装效果的装备，玩家需要根据职业特点选择核心输出套装，并巧妙混搭其他套装部件以激活多重增益。高级装备还拥有刻印孔，可以镶嵌不同颜色的刻印，这些刻印自身也能形成套装效果，进一步强化角色的特定属性或技能。从前期过渡装备到后期毕业套装，如龙家至尊、无尽暗魔之力等，玩家需要通过持续挑战对应的高阶副本来获取和迭代，装备与刻印的取舍、套装效果的激活组合，共同构成了角色养成的深度与广度，直接影响其在副本中的输出和生存能力。
游戏提供了多样化的副本类型，以满足玩家不同阶段的成长需求和追求更高的挑战。除了推进剧情的主线副本，还有诸如昼夜空间这类产出特定强化材料的日常副本，里武林及其更高难度的湮灭模式则是获取各职业专属套装和稀有刻印的主要途径。还有无尽劫境这类爬塔玩法产出技能精研点，极境试炼提供代币兑换奖励，以及支持多人协作的团队副本和限时开放的活动副本。每种副本都有其独特的进入条件、消耗机制（如体力或特殊钥匙）和轮换规则，要求玩家合理规划资源，针对性地选择挑战目标以最大化成长效率。
部分副本引入了独特的机制，考验玩家对战斗节奏的精准把控和即时反应。昼夜空间的核心玩法并非一味强攻，而是要求玩家观察敌人攻击前摇，通过精准的完美格挡触发绝对防御并将伤害反弹，以此击败特定敌人。在团队副本等高阶内容中，则存在严格的回合时间限制、首领阶段性伤害减免、以及需要优先击杀特定目标以获取团队增益等复杂机制。这些设计突破了单纯比拼数值的框架，要求玩家在熟练掌握自身技能链的基础上，还需理解副本机制，采取相应的战术策略，从而提升了副本挑战的策略维度与操作上限。
影之刃3的副本玩法通过融合随机生成的地图、深度定制的技能心法搭配、丰富的装备刻印养成体系以及多样化的副本类型与特殊机制，共同塑造了一个兼具动作爽快感与策略构筑深度的刷图体验。尽管该游戏已于2025年停止运营，但其副本设计的诸多理念，如鼓励自由探索、构建个人流派以及注重机制应对等，仍构成了其作为一款横版动作角色扮演游戏的核心魅力所在。
