战舰的选择直接影响战斗效率和资源回报。综合性能最强的战舰当属康斯但丁大帝级综合战列巡洋舰，定位为中排输出核心，搭载脉冲炮和重型能量导弹系统，改造空间大且防御能力优秀。航母方面，太阳鲸武装战略航空母舰凭借均衡属性和战略价值成为舰队核心，适合中后期资源充足的玩家。
护卫舰中雷利亚特级是性价比极高的选择，前期容易获取且后期仍能发挥作用，点完科技点可额外增加弹头伤害。红宝石级重型轨道炮护卫舰和刺水母级战术护卫舰也是护卫舰中的佼佼者，前者满改后伤害突出，后者则是万金油型多功能舰。驱逐舰方面，斗牛级脉冲炮驱逐舰和创神星级鱼雷型驱逐舰输出能力优秀，尤其斗牛级对新手友好，加点灵活且实战表现稳定。
巡洋舰中卡利斯托集束鱼雷袭击舰输出能力远超同级，生存能力也有保障，适合作为后排主力。猎兵级重型舰载机巡洋舰和艾奥级攻坚离子炮巡洋舰则分别擅长载机支援和能量伤害，可根据战场需求灵活搭配。需巡洋舰造价较高，建议优先培养1-2艘核心舰船，避免资源分散导致战力不足。
舰队搭配需要兼顾功能性和站位分配。防御型舰船如奇美拉级重型巡洋舰应放在前排吸收伤害，中后排则配置输出舰和支援舰。奶船苔原级或卫士级能有效提升舰队续航，防空型舰船如光锥级则针对敌方舰载机阵容。不要盲目追求高稀有度战舰，合理利用现有蓝图和子型号改造同样能组建强力舰队。
战舰强度会随战场环境变化，比如蜂巢守卫者导弹舰在混战中表现突出，但对单体目标效果一般。多关注舰船的子型号特性，比如载机型AC721搭配蜂巢护航艇能发挥奇效。实战中根据对手阵容调整配置，才是成为高手的必经之路。
